In einem Interview mit dem Tagesspiegel äußerte Fischer, dass eine Kooperation oder Koalition mit der AfD die CDU spalten würde und die Unabhängigkeit der Justiz sowie die Kultur- und Wissenschaftsfreiheit bedrohen könnte. Angesichts der hohen Umfragewerte der AfD in Sachsen-Anhalt und Mecklenburg-Vorpommern warnte er vor den Folgen einer Regierungsverantwortung für die rechtsextreme Partei, die das internationale Vertrauen in Deutschland gefährden würde.